Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CXXC1Q9P0U4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CXXC1Q9P0U4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms