Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VAPAQ9P0L0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms