Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERVK13-1Q9NX77 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms