Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q9NX04 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q9NX04 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms