Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GSDMCQ9BYG8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms