Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms