Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFHD1Q9BUP0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms