Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD2Q9BTF0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD2Q9BTF0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms