Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
LYSTQ99698 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LYSTQ99698 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms