Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PITX2Q99697 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms