Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TRAPPC9Q96Q05 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms