Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
OPALINQ96PE5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.8 ms