Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP44Q96MT7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP44Q96MT7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms