Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC7Q96M83 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC7Q96M83 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms