Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SGCZQ96LD1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms