Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC136Q96JN2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms