Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIC2Q96JB3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIC2Q96JB3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms