Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EFHD2Q96C19 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EFHD2Q96C19 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms