Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPL3LQ92901 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms