Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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RABGGTAQ92696 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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RABGGTAQ92696 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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RABGGTAQ92696 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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RABGGTAQ92696 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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RABGGTAQ92696 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RABGGTAQ92696 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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