Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBXN4Q92575 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBXN4Q92575 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms