Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRTOMTQ8WZ04 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRTOMTQ8WZ04 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRTOMTQ8WZ04 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRTOMTQ8WZ04 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRTOMTQ8WZ04 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRTOMTQ8WZ04 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRTOMTQ8WZ04 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms