Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW43

APH1B, Gamma-secretase subunit APH-1B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1BQ8WW43 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APH1BQ8WW43 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms