Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATL2Q8NHH9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATL2Q8NHH9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms