Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMIEQ8NEW7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms