Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SFRP1Q8N474 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms