Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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C9orf40Q8IXQ3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C9orf40Q8IXQ3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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