Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX20Q7Z614 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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