Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GDPD3Q7L5L3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GDPD3Q7L5L3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms