Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FOXD4L3Q6VB84 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms