Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZBED9Q6R2W3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED9Q6R2W3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms