Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC174Q6PII3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms