Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RWDD4Q6NW29 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RWDD4Q6NW29 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms