Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
KRT80Q6KB66 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT80Q6KB66 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms