Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PRAMEF8Q5VWM4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PRAMEF8Q5VWM4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms