Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P8

SYT6, Synaptotagmin-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6Q5T7P8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SYT6Q5T7P8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYT6Q5T7P8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms