Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
COL5A1-AS1Q5SY13 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms