Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AMER1Q5JTC6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMER1Q5JTC6 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms