Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAVIN4Q5BKX8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CAVIN4Q5BKX8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms