Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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RPL39P5Q59GN2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL39P5Q59GN2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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RPL39P5Q59GN2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RPL39P5Q59GN2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RPL39P5Q59GN2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL39P5Q59GN2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RPL39P5Q59GN2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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RPL39P5Q59GN2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL39P5Q59GN2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL39P5Q59GN2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL39P5Q59GN2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL39P5Q59GN2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL39P5Q59GN2 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL39P5Q59GN2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL39P5Q59GN2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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