Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DCAF6Q58WW2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms