Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTXN3Q4LDR2 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CTXN3Q4LDR2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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