Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI81

KRTAP27-1, Keratin-associated protein 27-1, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP27-1Q3LI81 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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KRTAP27-1Q3LI81 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KRTAP27-1Q3LI81 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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