Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDO1Q16878 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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CDO1Q16878 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDO1Q16878 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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