Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DDR2Q16832 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms