Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HIF1AQ16665 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HIF1AQ16665 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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