Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
NTRK2Q16620 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NTRK2Q16620 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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