Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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RPE65Q16518 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RPE65Q16518 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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