Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TAF1AQ15573 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TAF1AQ15573 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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