Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDSNQ15517 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms